O Pico da Pedra é uma elevação de origem vulcânica e assim é denominado por ter no seu topo uma enorme pedra vermelha.
O povoamento deste concelho iniciou-se nos finais do século XV, pouco tempo após a vinda dos primeiros colonos para S. Miguel.
Já no século XVI eram estas paragens habitadas, sabendo-se, no entanto, que Pico da Pedra não era freguesia, sendo, por isso, das de mais recente criação neste concelho.
Manuel Moniz, cidadão de Ponta Delgada, a quem se deve a construção da Ermida de Nossa Senhora dos Prazeres, diz em seu testamento de 31 de Março de 1604 “que a construiu junto da casa que herdara da mãe”.
Em 1735 foi este lugar feito curato sufragâneo e em 1836 foi elevado à categoria de paróquia independente.
A edificação da actual Igreja de Nossa Senhora dos Prazeres iniciou-se em 2 de Fevereiro de 1802, tendo sido dada por concluída em 1807.
Desde a construção da primitiva ermida aqui teve culto consagrado o Espírito Santo.